方剂学科是中医基础通向临床的桥梁学科，1998年获硕士学位授予权。现为安徽省重中之重学科、博士学位授权建设学科中医学学科的主干二级学科。《方剂学》课程2007年被遴选为省级精品课程。学科目前拥有教授2人、副教授3人，讲师6人。其中具有博士学位3人，硕士学位5人，硕士研究生导师5人，安徽省高校拔尖人才1人，安徽省高校学科带头人培养对象1人，形成了结构合理的教学与科研梯队。

学科围绕方剂的文献与组方理论研究、方剂的配伍规律研究、方剂的临床应用及疗效客观化研究、方剂的疗效机制及新药研究等研究方向开展了一系列研究工作，并取得丰硕成果。先后承担国家自然科学基金项目4项，安徽省自然科学基金项目、安徽省教育厅自然科学研究重点项目、安徽省高等学校青年教师科研资助计划自然科学项目等科研项目12项，参与国家自然科学基金、省（部）级、厅（局）级科研项目10余项，取得省级科技奖励3项，在国家、省级学术期刊发表高水平的学术论文100余篇。学科先后承担省级教学研究项目2项，主编、副主编或参编《方剂学》、《中医英语》、《医学英语》等国家级规划、统编教材及学术专著20余部，发表教学研究论文10余篇。已培养出具有坚实的方剂基础理论、较强的科学研究能力和临床诊疗技能的硕士研究生近40名，分布在省内外的教学、科研、临床工作岗位，成为学科带头人或业务骨干。